由于兩年前揭發同僚貪污，臺北警官黃火土(梁家輝)被上級報復調入冷門的外事組工作，利益也曾連帶受損的新同事對他怒言相向，加上妻子清芳(劉若英)受不了他長期不回家要求離婚，黃火土感覺他的世界正在逐漸四分五裂。 就在此時，三宗受害者的身份并無關聯的震驚了臺灣社會的離奇命案發生，法醫(楊貴媚)驗尸發現他們都是因中一種神秘的黑霉菌產生幻覺而死，因為缺乏此方面的人才，當局從美國請來此種案例的偵辦專家凱文萊特(David Morse)協助破案，黃火土重被任用。隨著一樁令所有人都目瞪口呆的事實的被發現，一場圍繞政治利益與民眾利益的斗爭也在黃火土和辦案伙伴李豐博(戴立忍)及整個警察隊伍之間展開。