所謂“煉金術”，即通過不同組合產生“金”的技術。人工孕育“生物”的嘗試亦作為神秘研究之一，種種實驗將在不為人知的現代為舞臺展開故事。本故事的關鍵在于糾合了煉金術中最高技術的產物“人工生命體(怪物)Chemy”，作為被保管在名為“RideChemyCard”的卡牌之中的101個生命體，Chemy為模仿蚱蜢、SL(蒸汽火車)等世上存在的萬物所制造。但是，本應被慎重保管著的它們卻突然從卡牌中冒出，一齊遭到釋放。偶然被卷入該事件的主人公為高中生·一之瀨寶太郎，被托付了假面騎士Gotchard的變身腰帶“Gotchar驅動器”，與回收散落于世間的Chemy的使命。