在首次墻外調查途中，懵懂無知的調查兵團成員遭遇了最為慘烈痛苦的一刻。而就在當時，艾倫?葉卡(三浦春馬 飾)被吞噬后竟也異變成巨人，并以壓倒性的攻勢消滅了其他巨人。幸存者們回到城中，而艾倫則被政府抓住，命懸一線。關鍵時刻，一只鎧甲巨人從天而降，抓走艾倫后迅速離開。當艾倫從昏迷中醒來，發現自己和敷島(長谷川博己 飾)置身于一個封閉的房間里。敷島淡定自若，向眼前的青年講述了巨人誕生的可怕真相。與此同時，三笠?阿克曼(水原希子 飾)、阿明?阿諾德(本鄉奏多 飾)等人經過討論后也展開相應行動。與巨人的對抗進入了新的階段……本片根據同名漫畫改編。