30年前，未知的“侵略性外來生物”突然出現(xiàn)，世界曾一度瀕臨毀滅。人類與這些被稱為“侵略種”的生物相互爭奪生存空間。雖然目前人類的安全勉強(qiáng)得到了保障，但世界隨時可能走向終結(jié)。人們在恐懼死亡與毀滅的同時，只能對危險(xiǎn)和災(zāi)難視而不見，麻木地過著日常生活。在這樣的世界里，聯(lián)合國危險(xiǎn)生物調(diào)查機(jī)構(gòu)“EXCEEDS”為了抵御“侵略種”帶來的危機(jī)與災(zāi)害，開始了行動。故事的開端位于遠(yuǎn)東的島國“瑞穗”。一位在離島上生活、以驅(qū)除“侵略種”為業(yè)的獵人少女久瀨椎名。她唯一的愿望就是與家中唯一的親人妹妹剎那平靜地生活下去。然而，降臨在椎名身上的事件究竟是？