2055年。手のひらサイズの小型ロボット[LBX]は世界最高のホビーと稱(chēng)され、プロリーグの設(shè)立などビジネスにおいても大きな存在感を放つ時(shí)代となっていた。そんな中、選りすぐりのプレイヤーが集うLBXのための學(xué)校[神威大門(mén)統(tǒng)合學(xué)園]に転入した少年、[瀬名アラタ]と[星原ヒカル]を待っていたのは、想像を超える出來(lái)事であった。學(xué)園の地下に広がる、直徑10kmの巨大ジオラマ。放課後にそこで繰り広げられる、[ウォータイム]という學(xué)園獨(dú)自の謎の規(guī)則。そして、LBX完全破壊(ロスト)による退學(xué)…。クラス委員長(zhǎng)[出雲(yún)ハルキ]のチーム[第1小隊(duì)]に配屬されたアラタとヒカルは、転入した2年5組、通稱(chēng)[ジェノック]のLBXプレイヤーとして、幾多の思惑が渦巻く學(xué)園の謎を背景に、壯絶な運(yùn)命へと身を投じる――！